全長轉(zhuǎn)錄組測序

全長轉(zhuǎn)錄組測序

基于PacBio三代測序平臺的全長轉(zhuǎn)錄組測序，可直接獲取mRNA全長序列，更為準(zhǔn)確地解讀mRNA結(jié)構(gòu)信息，重點關(guān)注基因的可變剪切、融合基因等。

測序應(yīng)用領(lǐng)域

◇ 獲得基因組未知物種的基因集，用于基因功能研究

◇ 基因結(jié)構(gòu)差異分析

◇ 發(fā)現(xiàn)新轉(zhuǎn)錄本

◇ 分子機制研究

◇ 基因表達(dá)調(diào)控研究

飛凡檢測測序的優(yōu)勢：

◇ 完善的樣品提取檢測方案，保障 mRNA 的完整性；

◇飛凡檢測擁有 PacBio Sequel 及 PacBio RSII 單分子測序平臺，提供測序服務(wù)；

◇ 深度測序推薦，挖掘低豐度基因信息；

◇ 分析團(tuán)隊，項目經(jīng)驗豐富，提供個性化分析內(nèi)容。

技術(shù)路線：

飛凡檢測關(guān)于全長轉(zhuǎn)錄組測序常見問題

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5. 1. PacBio測序平臺的技術(shù)原理？                                    

   利用 PacBio RS II/Sequel 進(jìn)行全長轉(zhuǎn)錄組測序，平臺包含 16 個測序模塊（SMRT cell），每個 SMRT cell 包含 15 萬/100萬個測序單元（零模波導(dǎo)孔，ZMWs）。需要將 mRNA 進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄并進(jìn)行環(huán)化處理，形成 CCS，每個 ZMW（零模波導(dǎo)孔）將容納 1 個 CCS 分子。由于全長轉(zhuǎn)錄組測序?qū)?mRNA 不進(jìn)行打斷，直接進(jìn)行上機測序，而每個 CCS 的片段長度不同，較小的 CCS 會先落入 ZMWs 中，而導(dǎo)致長片段很難測到。因此，在文庫構(gòu)建時，需要將 mRNA 根據(jù)長度分成不同的段，分別構(gòu)建文庫和測序。                                    

6.  2. PacBio測序平臺測序方案有什么推薦？                                    

   對樣本進(jìn)行分段處理，構(gòu)建不同片段長度的文庫，我們推薦每個樣本構(gòu)建3-6個文庫。 建議8-15G subreads。                                    

7. 3. 全長轉(zhuǎn)錄組測序分析內(nèi)容包括哪些？                                    

   分析內(nèi)容包括：轉(zhuǎn)錄本覆蓋度計算、轉(zhuǎn)錄本功能注釋、轉(zhuǎn)錄本GO 分類注釋、轉(zhuǎn)錄本 eggNOG分類注釋、轉(zhuǎn)錄本KEGG分類注釋、ORF分析、可變剪接分析等。   

飛凡檢測質(zhì)檢報告流程：

1、 提供產(chǎn)品資料

2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測項目，并給出報價

3、 確認(rèn)報價沒有問題，然后把樣品送到我們實驗室

4、 支付檢測費用，安排檢測

5、檢測完成，出具檢測報告，郵寄給客戶

咨詢熱線：18018131362

關(guān)于飛凡

飛凡檢測致力于打造國內(nèi)專業(yè)的第三方檢測服務(wù)公司，不斷優(yōu)化整合市場檢測資源，飛凡檢測與多家科研院所，如上海同濟大學(xué)，蘇州大學(xué)，SGS，TUV，以及國內(nèi)眾多知名的檢測公司進(jìn)行深度合作，共同為國內(nèi)制造業(yè)服務(wù)，為中國的制造業(yè)開拓海外市場保駕護(hù)航，為我們?nèi)粘Ｉ畹慕】蛋踩珮淞?biāo)桿；公司目前工程師百余人，95%以上是本科以上學(xué)歷；我們合作的實驗室通過CNAS，CMA（EZ），所出具的任何一張報告都有CNAS，CMA資質(zhì)，確保出具的每份報告都具有權(quán)威的法律效力。

為什么選擇我們

市場需求和成熟的模式給了我們成功的保證

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