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動(dòng)植物基因組測(cè)序

瀏覽次數(shù):969|來源:飛凡檢測(cè) | 2021-10-29 16:23:06

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基因組調(diào)研圖研究是對(duì)于沒有基因組參考序列的物種,基于小片段文庫(kù)的低深度測(cè)序數(shù)據(jù),可以有效地評(píng)估基因組大小、GC含量、雜合度高低以及重復(fù)序列含量等信息,是全面了解某一物種基因組特征的有效方法;此外,通過基因組調(diào)研分析也可對(duì)基因組進(jìn)行初步組裝。
項(xiàng)目周期:
動(dòng)植物基因組Survey開發(fā)時(shí)間為6周;3個(gè)樣品或以上,以及基因組大于1G為2個(gè)月。
開發(fā)時(shí)間以樣品到位并檢測(cè)合格為前提;收到樣品后,需要對(duì)樣品進(jìn)行檢測(cè),最終樣品的量和純度,以公司的檢測(cè)結(jié)果為準(zhǔn)。
測(cè)序平臺(tái)及策略:
整體測(cè)序深度不低于30倍覆蓋度;
預(yù)測(cè)基因組大小,評(píng)估基因組GC含量,評(píng)估基因組雜合率;
確定精細(xì)圖梯度文庫(kù)構(gòu)建具體策略
技術(shù)路線:

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分析內(nèi)容:
1.標(biāo)準(zhǔn)信息分析
數(shù)據(jù)基本處理,去低質(zhì)量和接頭序列;K-mer 分析以及基因組大小估計(jì);雜合率估計(jì);精細(xì)圖建庫(kù)方案評(píng)估;
2.高級(jí)信息分析(只針對(duì)純調(diào)研圖項(xiàng)目)

初步組裝;GC-Depth 分布分析,判斷測(cè)序偏好性;SSR標(biāo)記鑒定;樣品間SNP鑒定(多樣本情況下)

飛凡檢測(cè)質(zhì)檢報(bào)告流程:


1、 提供產(chǎn)品資料

2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測(cè)項(xiàng)目,并給出報(bào)價(jià)

3、 確認(rèn)報(bào)價(jià)沒有問題,然把樣品送到我們實(shí)驗(yàn)室

4、 支付檢測(cè)費(fèi)用,安排檢測(cè)

5、檢測(cè)完成,出具檢測(cè)報(bào)告,郵寄給客戶

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關(guān)于飛凡


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飛凡檢測(cè)致力于打造國(guó)內(nèi)專業(yè)的第三方檢測(cè)服務(wù)公司,不斷優(yōu)化整合市場(chǎng)檢測(cè)資源,飛凡檢測(cè)與多家科研院所,如上海同濟(jì)大學(xué),蘇州大學(xué),SGS,TUV,以及國(guó)內(nèi)眾多知名的檢測(cè)公司進(jìn)行深度合作,共同為國(guó)內(nèi)制造業(yè)服務(wù),為中國(guó)的制造業(yè)開拓海外市場(chǎng)保駕護(hù)航,為我們?nèi)粘I畹慕】蛋踩珮淞?biāo)桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學(xué)歷;我們合作的實(shí)驗(yàn)室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報(bào)告都有CNAS,CMA資質(zhì),確保出具的每份報(bào)告都具有權(quán)威的法律效力。


為什么選擇我們

市場(chǎng)需求和成熟的模式給了我們成功的保證


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