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LncRNA測(cè)序

瀏覽次數(shù):1048|來(lái)源:飛凡檢測(cè) | 2021-11-15 17:12:55

長(zhǎng)鏈非編碼 RNA(Long non-coding RNA, LncRNA)是長(zhǎng)度大于 200 個(gè)核苷酸的非編碼 RNA(不含 rRNA)。研究表明 , LncRNA 在劑量補(bǔ)償效應(yīng)、表觀遺傳調(diào)控、細(xì)胞周期調(diào)控和細(xì)胞分化調(diào)控等眾多生命活動(dòng)中發(fā)揮重要作用,成為遺傳學(xué)研究熱點(diǎn)。通過(guò) LncRNA 測(cè)序,可以快速獲得與其生物學(xué)過(guò)程或者疾病相關(guān)的 LncRNA 表達(dá)變化,促進(jìn)其深入研究。


飛凡檢測(cè)LncRNA 測(cè)序方案設(shè)計(jì)

LncRNA 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路為差異比較,常見的類型為實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組(case VS control),進(jìn)行兩兩比較;若考慮時(shí)空因素,如按照不同生長(zhǎng)發(fā)育階段或者疾病發(fā)生發(fā)展整個(gè)過(guò)程進(jìn)行比較,即進(jìn)行多重比較分析,然后對(duì)差異的LncRNA 進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè)和富集分析。一組樣品建議至少 6 個(gè)生物學(xué)重復(fù)。


技術(shù)流程

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樣本要求


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飛凡檢測(cè)LncRNA 測(cè)序項(xiàng)目

LncRNA分析項(xiàng)目?jī)?nèi)容


飛凡檢測(cè)LncRNA測(cè)序分析結(jié)果展示



基因結(jié)構(gòu)表達(dá)圖


GO有向無(wú)環(huán)圖



  • lncRNA常見問題-飛凡檢測(cè)

  • 哪些物種可以研究lncRNA?

    要做lncRNA分析,對(duì)物種有以下要求:

    a. 物種為真核生物;

    b. 物種具有參考基因組;

    c. 具有較為完整的注釋。

  • 為什么lncRNA要測(cè)鏈特異性文庫(kù)?

    測(cè)序后的數(shù)據(jù)分析可確定轉(zhuǎn)錄本是來(lái)自正義還是反義DNA鏈。與普通轉(zhuǎn)錄組測(cè)序相比,它更能準(zhǔn)確地統(tǒng)計(jì)轉(zhuǎn)錄本的數(shù)量和確定基因的結(jié)構(gòu),同時(shí)可以發(fā)現(xiàn)更多的反義轉(zhuǎn)錄本,可以更好地鑒定antisense lncRNA。                                    

  • lncRNA測(cè)序,構(gòu)建文庫(kù)時(shí)為什么要去除rRNA?

    lncRNA中只有l(wèi)incRNA的3’端帶有polyA結(jié)構(gòu),其他lncRNA沒有polyA結(jié)構(gòu),因此,為了獲得更全的lncRNA信息,不建議采用oligo(dT)磁珠富集的方式。

  • 什么是LncRNA測(cè)序?

    LncRNA-長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long noncoding RNA)是一類長(zhǎng)度超過(guò)200nt的RNA分子,它們少有蛋白編碼潛能,并且能夠和DNA、RNA及蛋白質(zhì)結(jié)合,以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等)調(diào)控基因的表達(dá)水平。LncRNA測(cè)序是研究已有參考基因組物種的特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定時(shí)期轉(zhuǎn)錄出的LncRNA和mRNA。

  • LncRNA測(cè)序的條件

    有參考基因組,并且有LncRNA注釋信息:常見的包括人、小鼠、大鼠、豬、牛、兔、斑馬魚、酵母、擬南芥、果蠅、秀麗線蟲;擬南芥、玉米、葡萄、金銀花、水稻、西紅柿、大豆。


飛凡檢測(cè)質(zhì)檢報(bào)告流程:


  • 1、 提供產(chǎn)品資料

  • 2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測(cè)項(xiàng)目,并給出報(bào)價(jià)

  • 3、 確認(rèn)報(bào)價(jià)沒有問題,然后把樣品送到我們實(shí)驗(yàn)室

  • 4、 支付檢測(cè)費(fèi)用,安排檢測(cè)

  • 5、檢測(cè)完成,出具檢測(cè)報(bào)告,郵寄給客戶

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  • 關(guān)于飛凡


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飛凡檢測(cè)致力于打造國(guó)內(nèi)專業(yè)的第三方檢測(cè)服務(wù)公司,不斷優(yōu)化整合市場(chǎng)檢測(cè)資源,飛凡檢測(cè)與多家科研院所,如上海同濟(jì)大學(xué),蘇州大學(xué),SGS,TUV,以及國(guó)內(nèi)眾多知名的檢測(cè)公司進(jìn)行深度合作,共同為國(guó)內(nèi)制造業(yè)服務(wù),為中國(guó)的制造業(yè)開拓海外市場(chǎng)保駕護(hù)航,為我們?nèi)粘I畹慕】蛋踩珮淞?biāo)桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學(xué)歷;我們合作的實(shí)驗(yàn)室通過(guò)CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報(bào)告都有CNAS,CMA資質(zhì),確保出具的每份報(bào)告都具有權(quán)威的法律效力。


  • 為什么選擇我們

  • 市場(chǎng)需求和成熟的模式給了我們成功的保證


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