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多肽從頭測序
多肽的序列分析常見的有兩種方法:數(shù)據(jù)庫搜索和de novo從頭測序法。數(shù)據(jù)庫搜索需要在已知/給定的數(shù)據(jù)庫中進行搜庫,從而對多肽序列進行識別。但是由于有些物種的數(shù)據(jù)庫不足,很多新的或是活性肽無法在數(shù)據(jù)中匹配到。多肽從頭測序可以解決這個難題。多肽從頭測序是指在沒有序列數(shù)據(jù)庫的幫助下,利用串聯(lián)質譜(MS/MS)獲取肽的氨基酸序列的分析過程。優(yōu)勢在于,無論有沒有理論數(shù)據(jù)庫,抑或是新的、未知的多肽均可對其進行序列分析。
從頭測序的基本原理是利用兩個片段離子之間的質量差來計算肽鏈上氨基酸殘基的質量。多肽從頭測序技術的實現(xiàn)與質譜技術的發(fā)展緊密相關。近年來質譜的質量分辨率提高了好幾個數(shù)量級,尤其是高精確質譜性能的顯著提高為多肽序列分析提供了有力的基礎。
飛凡檢測使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀結合Nano-LC納升色譜技術,提供基于質譜的多肽de novo從頭測序服務,對多肽序列進行分析。我們使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀實現(xiàn)對肽段樣品的序列分析,Obitrap Fusion Lumos質譜儀是現(xiàn)在分辨率和靈敏度最高的質譜儀,保證了低豐度肽段碎裂片段鑒定的靈敏度;同時在肽段碎裂過程中采取HCD與ETD結合的模式,保證肽段碎裂片段的完整性。得到質譜原始數(shù)據(jù)之后,采用從頭測序的方式對多肽序列進行推導。
樣品制備的建議:
盡可能準備20 ug以上的樣品,溶液和凍干粉均可。如果是溶液樣品,buffer中不含有高鹽、SDS等去垢劑。
**可咨詢飛凡檢測的技術人員,有針對性的進行樣品制備。
飛凡檢測可對來自液體及固體狀態(tài)下的樣品進行多肽序列分析。固體樣品,使用冰袋運輸即可;溶液樣品,可進行真空抽干或冷凍抽干后,使用冰袋運輸,也可通過干冰對樣品進行運輸。歡迎來電咨詢。
飛凡檢測質檢報告流程:
1、 提供產品資料2、 工程師根據(jù)您的產品推薦合適檢測項目,并給出報價
3、 確認報價沒有問題,然后把樣品送到我們實驗室
4、 支付檢測費用,安排檢測
5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶
咨詢熱線:18018131362
關于飛凡
飛凡檢測致力于打造國內專業(yè)的第三方檢測服務公司,不斷優(yōu)化整合市場檢測資源,飛凡檢測與多家科研院所,如上海同濟大學,蘇州大學,SGS,TUV,以及國內眾多知名的檢測公司進行深度合作,共同為國內制造業(yè)服務,為中國的制造業(yè)開拓海外市場保駕護航,為我們日常生活的健康安全樹立標桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學歷;我們合作的實驗室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報告都有CNAS,CMA資質,確保出具的每份報告都具有權威的法律效力。
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