環(huán)狀RNA測序

環(huán)狀RNA（circular RNA，circRNA）呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)，是最近研究的熱點，它大量存在于真核細胞胞質(zhì)內(nèi)，主要由pre-mRNA通過可變剪切加工產(chǎn)生，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定，不易降解。

近年的研究表明，circRNA具有重要的調(diào)控功能，例如circRNA可發(fā)揮競爭性內(nèi)源RNA（ceRNA）機制，由于其分子富含microRNA（miRNA）結(jié)合位點，在細胞中起到miRNA海綿的作用，進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表達水平。特別是通過與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用，研究證明circRNA能影響癌癥細胞的增殖、浸潤與轉(zhuǎn)移、血管生成以及細胞凋亡。除此以外，circRNA也具有調(diào)控其他類型RNA、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)活性等功能。

這些特性使得circRNA具有開發(fā)疾病新型診斷與治療方法的潛力，研究意義重大。circRNA測序的主要應(yīng)用領(lǐng)域有腫瘤等疾病致病機理研究；生長發(fā)育過程中的基因表達調(diào)控變化；其他關(guān)心基因轉(zhuǎn)錄表達調(diào)控的研究方向等。

技術(shù)流程

數(shù)據(jù)分析

標準分析

• 原始數(shù)據(jù)質(zhì)控

• 比對到參考基因組

• circRNA鑒定與統(tǒng)計：統(tǒng)計reads類型、circRNA類型與分布

• 來源基因富集分析

• circRNA注釋

• 表達量計算與樣品間表達差異分析

• 差異基因GO分析；KEGG分析

• 生物學(xué)重復(fù)樣品間相關(guān)性分析

• circRNA序列預(yù)測

高級分析

• circRNA保守性分析

• circRNA、miRNA、mRNA互作分析

技術(shù)參數(shù)

樣本要求

技術(shù)參數(shù)

飛凡檢測質(zhì)檢報告流程：

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  1、 提供產(chǎn)品資料

• 2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測項目，并給出報價

• 3、 確認報價沒有問題，然后把樣品送到我們實驗室

• 4、 支付檢測費用，安排檢測

• 5、檢測完成，出具檢測報告，郵寄給客戶

• 咨詢熱線：18018131362

• 關(guān)于飛凡

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