基因技術(shù)服務(wù)
飛凡標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)服務(wù)(蘇州)有限公司
全長轉(zhuǎn)錄組測序
全長轉(zhuǎn)錄組測序(Iso-Seq)是基于PacBio單分子實時測序技術(shù),憑借超長讀長的優(yōu)勢(平均讀長10-15Kb),可以輕松跨越從5'末端到3'-Poly A尾的完整轉(zhuǎn)錄本,無需打斷RNA分子,從而獲得高質(zhì)量全長轉(zhuǎn)錄本序列。
通過全長轉(zhuǎn)錄組測序能夠更精準(zhǔn)地得到mRNA全長序列及完整結(jié)構(gòu)信息,可以對新基因及其Iso-form進行更全面的研究,克服了轉(zhuǎn)錄本二代測序拼接短、信息不完整的難題;實現(xiàn)對可變剪接、同源異構(gòu)體、同源基因、等位基因、融合基因等精確分析。主要應(yīng)用領(lǐng)域有比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)、發(fā)育轉(zhuǎn)錄組學(xué)、環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學(xué)、輔助基因組注釋、腫瘤疾病研究等。
技術(shù)流程
數(shù)據(jù)分析
全長無參轉(zhuǎn)錄組分析
標(biāo)準(zhǔn)分析:
1. 原始數(shù)據(jù)處理
2. 全長轉(zhuǎn)錄本分析:插入片段質(zhì)控、轉(zhuǎn)錄本分類、聚類與矯正
3. 轉(zhuǎn)錄本注釋:Gene Ontology分析、KEGG pathway分析、KOG或COG分析、Swissport分析
4. 基因結(jié)構(gòu)分析:可變剪切分析、SSR分析、CDS分析、LncRNA分析、基因家族分析
高級分析:
1. 參考序列比對
2. 表達水平分析
3. 差異表達分析
4. 差異表達轉(zhuǎn)錄本KEGG富集分析
5. 差異表達熱圖分析
6. 差異表達轉(zhuǎn)錄本GO富集分析
全長有參轉(zhuǎn)錄組分析
標(biāo)準(zhǔn)分析:
1. 原始數(shù)據(jù)處理
2. 全長轉(zhuǎn)錄本分析:插入片段質(zhì)控、轉(zhuǎn)錄本分類、聚類與矯正、與參考基因組比對
3. 轉(zhuǎn)錄本注釋:Gene Ontology分析、KEGG pathway分析、KOG或COG分析、Swissport分析
4. 基因結(jié)構(gòu)分析:轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)注釋、可變剪切分析、SSR分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測、CDS分析、LncRNA分析、融合基因鑒定
高級分析:
1. 參考序列比對
2. 表達水平分析
3. 差異表達分析
4. 差異表達轉(zhuǎn)錄本KEGG富集分析
5. 差異表達熱圖分析
6. 差異表達轉(zhuǎn)錄本GO富集分析
7. 基因表達趨勢分析
8. 權(quán)重共表達網(wǎng)絡(luò)分析
9. 樣本間差異融合基因比較
樣本要求
技術(shù)參數(shù)
飛凡檢測質(zhì)檢報告流程:
1、 提供產(chǎn)品資料2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測項目,并給出報價
3、 確認(rèn)報價沒有問題,然后把樣品送到我們實驗室
4、 支付檢測費用,安排檢測
5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶
咨詢熱線:18018131362
關(guān)于飛凡
飛凡檢測致力于打造國內(nèi)專業(yè)的第三方檢測服務(wù)公司,不斷優(yōu)化整合市場檢測資源,飛凡檢測與多家科研院所,如上海同濟大學(xué),蘇州大學(xué),SGS,TUV,以及國內(nèi)眾多知名的檢測公司進行深度合作,共同為國內(nèi)制造業(yè)服務(wù),為中國的制造業(yè)開拓海外市場保駕護航,為我們?nèi)粘I畹慕】蛋踩珮淞?biāo)桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學(xué)歷;我們合作的實驗室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報告都有CNAS,CMA資質(zhì),確保出具的每份報告都具有權(quán)威的法律效力。
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