全長(zhǎng)16S/18S/ITS擴(kuò)增子測(cè)序

目前，16S/18S/ITS rRNA是微生物分類(lèi)鑒定和系統(tǒng)發(fā)育的指標(biāo)。原核微生物的16S rRNA基因長(zhǎng)度約為1500 bp，包含10個(gè)保守區(qū)和9個(gè)高變區(qū)（V1-V9），同時(shí)具有高度的保守性和特異性，保守區(qū)可反映菌屬間的親緣關(guān)系，可變區(qū)體現(xiàn)菌屬之間的差異。真核微生物18S rRNA基因長(zhǎng)度約為1500~2000 bp，序列中也既有保守區(qū)和可變區(qū)，由于進(jìn)化速率比較保守，適用于種級(jí)以上的分類(lèi)鑒定。真核微生物ITS長(zhǎng)度約為500 bp，在種內(nèi)不同菌株之間高度保守，而在菌種間存在較大的變化，表現(xiàn)出極大的序列多態(tài)性，被廣泛應(yīng)用于生物種間系統(tǒng)發(fā)育和研究。

既往的16S/18S/ITS rRNA擴(kuò)增子測(cè)序針對(duì)其序列的單個(gè)或連續(xù)的兩個(gè)或三個(gè)可變區(qū)設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增再測(cè)序分析；而現(xiàn)在基于三代PacBio SMRT測(cè)序平臺(tái)，我們使用27F/1492R的引物，平均讀長(zhǎng)10~18 K，可輕松覆蓋16S/18S/ITS rRNA全長(zhǎng)序列，突破二代測(cè)序讀長(zhǎng)短的局限性，實(shí)現(xiàn)精確到“種”的分類(lèi)鑒定，可在多個(gè)領(lǐng)域應(yīng)用如物種進(jìn)化、物種豐度、環(huán)境與生態(tài)、醫(yī)學(xué)領(lǐng)域等，研究表皮微生物的關(guān)系、人體腸道微生物與疾病。

技術(shù)流程

數(shù)據(jù)分析

我們使用Circular Consensus Sequencing（CCS）的算法來(lái)矯正測(cè)序產(chǎn)生的錯(cuò)誤，提高測(cè)序的準(zhǔn)確性。通過(guò)去除barcode以及長(zhǎng)度小于150 bp以及模棱兩可的序列，通過(guò)99%的相似性產(chǎn)生OTU和比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)最后進(jìn)行分類(lèi)。

樣本要求

技術(shù)參數(shù)

飛凡檢測(cè)質(zhì)檢報(bào)告流程：

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  1、 提供產(chǎn)品資料

• 2、 工程師根據(jù)您的產(chǎn)品推薦合適檢測(cè)項(xiàng)目，并給出報(bào)價(jià)

• 3、 確認(rèn)報(bào)價(jià)沒(méi)有問(wèn)題，然后把樣品送到我們實(shí)驗(yàn)室

• 4、 支付檢測(cè)費(fèi)用，安排檢測(cè)

• 5、檢測(cè)完成，出具檢測(cè)報(bào)告，郵寄給客戶(hù)

• 咨詢(xún)熱線(xiàn)：18018131362

• 關(guān)于飛凡

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飛凡檢測(cè)致力于打造國(guó)內(nèi)專(zhuān)業(yè)的第三方檢測(cè)服務(wù)公司，不斷優(yōu)化整合市場(chǎng)檢測(cè)資源，飛凡檢測(cè)與多家科研院所，如上海同濟(jì)大學(xué)，蘇州大學(xué)，SGS，TUV，以及國(guó)內(nèi)眾多知名的檢測(cè)公司進(jìn)行深度合作，共同為國(guó)內(nèi)制造業(yè)服務(wù)，為中國(guó)的制造業(yè)開(kāi)拓海外市場(chǎng)保駕護(hù)航，為我們?nèi)粘Ｉ畹慕】蛋踩珮?shù)立標(biāo)桿；公司目前工程師百余人，95%以上是本科以上學(xué)歷；我們合作的實(shí)驗(yàn)室通過(guò)CNAS，CMA（EZ），所出具的任何一張報(bào)告都有CNAS，CMA資質(zhì)，確保出具的每份報(bào)告都具有權(quán)威的法律效力。

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• 為什么選擇我們

• 市場(chǎng)需求和成熟的模式給了我們成功的保證

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