三代宏基因組測序

宏基因組學（Metagenomics）又叫元基因組學、微生物環(huán)境基因組學。是直接從特定環(huán)境樣本中提取全部微生物的總DNA（也稱宏基因組，metagenome），對其進行高通量測序、序列組裝和基因注釋，獲得環(huán)境微生物基因組信息總和，以研究環(huán)境微生物的群落結構、物種分類、系統進化、基因功能以及代謝通路等。擺脫了傳統研究中微生物分離培養(yǎng)的技術限制，在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優(yōu)勢，其應用滲透到各個領域, 包括醫(yī)學、農業(yè)、畜牧、環(huán)境等。

近年來，新一代測序技術（Next Generation Sequencing）的發(fā)展使研究宏基因組的方法也已經發(fā)生了變化，人們可以較快速準確的得到大量生物數據和豐富的微生物研究信息，從而成為研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。伴隨著PacBio測序平臺的問世，宏基因組學的研究又增加了一個有力的研究途徑，其長讀長、無GC偏向和無PCR擴增等優(yōu)勢可以獲得更多信息，避免二代測序技術在面對復雜微生物群落時的瓶頸：因讀長短、不能跨越重復序列、高GC含量序列等，無法真正揭示菌群的復雜情況。

利用三代實時單分子測序PacBio SMRT技術，我們可以獲得更多基因組信息，更準確的物種分類，更多的物種鑒定，較為全面地刻畫微生物群落各方面的特性，可最真實的還原環(huán)境中微生物群落信息，從而深入探討它們對于整個生態(tài)系統的重要意義。

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